分公司不行，子公司可以。
因為分公司沒有資格單獨申請高新技術企業認定的資格，但是可以與總公司共同享受稅收優惠。
子公司是具有獨立法人資格的，因此只要符合《高新技術企業認定管理辦法》中的相關要求，就可以單獨申請高新技術企業的認定，且成功認定后同樣能享受到稅收優惠。
高新技術企業申請時間
每年年初科委會公布該年的高新認證時間，比如，2017年北京市就有三批高新技術企業認定，其時間分別為：年初-5月31日、6月1日-8月11日、8月12日-10月9日。
另外，認定周期一般是自受理起3-5個月，從2016年最新修訂印發的《高新技術企業新認定管理辦法 》執行后，一般在認定截止時間約2個月后公示，公示后2個月左右頒發高新技術企業證書，具體公示及領證時間以科委實際頒布時間為準。
通過認定的高新技術企業，其資格自頒發證書之日起有效期為三年。
高新技術企業注意事項
1、由于材料比較繁雜，欲申請認定為高新技術企業，應盡量提早準備；
2、應按照《工作指引》的要求，仔細對照檢查是否符合認定條件；
3、出具研發費用專項審計報告和高新技術產品（服務）收入專項審計報告時，注意選擇經認定主管部門備案的會計師事務所，且研發項目和銷售合同必須屬于企業的主營業務領域。
4、所有提供的材料的證據必須提供足夠的、有說服力的佐證材料，例如：知識產權證明的所有人必須是申請企業，必須在有效期內等。
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